Die Kardiochirurgie kann in Bad Berka auf eine lange Tradition zurückblicken. Bereits seit dem Ende der 60-er Jahre werden hier Operationen am offenen Herzen durchgeführt. In den 70-er Jahren entwickelte sich die Kardiochirurgie in Bad Berka zum leistungsfähigsten Zentrum auf dem Gebiet der ehemaligen DDR.
Nach der Gründung der Zentralklinik Bad Berka GmbH im Jahre 1991 erfolgte ein großzügiger Neu- und Umbau des gesamten Gebäudes. Insbesondere durch den Neubau des Operations-Traktes mit der Intensivstation konnte die Kapazität erheblich gesteigert werden. Aufgrund der Eröffnung weiterer Herzzentren sowie der permanent steigenden Zahl von kardiologischen-interventionellen Maßnahmen (PTCA, Stent) ist die Zahl der herzchirurgischen Operationen inzwischen zurückgegangen, wobei es gelungen ist, die Warteliste nahezu vollständig abzubauen.

In der Klinik für Kardiochirurgie erfolgt die operative Behandlung von angeborenen Herzfehlern im Kindes- und Erwachsenenalter, die Chirurgie der erworbenen Krankheiten des Herzens, der Herzklappen, der Herzhüllen sowie der Erkrankungen der Herzkranzgefäße und deren Folgezustände, auch in minimalinvasiver Technik und unter Verzicht auf den Einsatz der Herz-Lungen-Maschine. Besondere Schwerpunkte sind neben Operationen an den Herzkranzgefäßen (Bypassoperationen) die Durchführung herzklappenerhaltender Operationen. Außerdem werden Operationen bei Erkrankungen, Fehlbildungen und Verletzungen der großen herznahen Gefäße, insbesondere der auf- und absteigenden Hauptschlagader und der Halsschlagader sowie Operationen bei Erkrankungen des Reizleitungssystems (Implantation von Herzschrittmachern und Defibrillatoren) und von Herzrhythmusstörungen (Vorhofablation) durchgeführt.